Pamukçuk, bebeklerde görülen bir mantar enfeksiyonudur. Candida albicans denilen bir mantarın etkin olduğu ağız içi enfeksiyonudur. Bu mantar yetişkinlerde genellikle ağız florasında ve vajinal florada bulunur. Doğum sırasında, normal doğum sonrası candida albicans bebeğin solunum yollarına ve sindirim sistemine geçer. Bebeklerde genellikle en erken, 7. ve 10. aylarda ortaya çıkar. Ağız içinde beyaz lezyonlarla karakterizedir. Yani pamukçuk mikrobik bir hastalıktır, etkeni mantardır.

Zamanında doğan yeni doğan bebeklerde daha az görülürken, prematüre yani erken doğan bebeklerde bu rahatsızlık daha sık görülür. Vücut direnci normal olan bir bebekte pamukçuk, genellikle ağız içinde lokalize halde bulunur. Ama vücut direnci zayıf olan bebeklerde bu mantar, yani candida albicans denilen mantar kana da karışabilmekte ve ağır akciğer enfeksiyonlarına neden olabilmektedir. Hatta daha ağır enfeksiyonlara da yol açabilmektedir. Ancak vücut direnci normal olan bebeklerde ağızda, dilde ve boğazda sınırlanmış bir enfeksiyondur.