Cinsiyet değiştirme ameliyatı plastik cerrahinin işidir. Ancak uygulamayı yapacak hekimin genel cerrahi bilgisi olması şarttır. Eski yıllarda doktorlar önce genel cerrahi daha sonra plastik cerrahi eğitimi alırlardı. Bu uygulama son 10-15 yıldır kaldırılmış durumda olduğu için, artık genel cerrahi eğitimi alınmadan plastik cerrah olunmaktadır. Cinsiyet değiştirme ameliyatı sırasında, çok kritik bir bölgede çalışılır. Altta bağırsak, üstte idrar yolu ve mesane vardır. Doktor bunun ikisinin arasından ilerleyerek bağırsak duvarına kadar gider. En küçük bir hatada bu organlar zarar görür. Telafisi son derece zor sakatlıklar meydana gelebilir. Burada bir hatadan kaçınmak ve daha rahat ilerleyebilmek için, genel cerrahi eğitimi önemlidir. Bu yüzden bir plastik cerrahın tek başına bu ameliyatı yapması çok zordur. Çok iyi bir eğitim görmesi gerekir. Ancak bu koşullarda bile bir genel cerrahın desteği şarttır.